Les deux autels qui flanquent le passage de la nef centrale au chœur de l’église sont consacrés à deux personnages appartenant au groupe des fondateurs de la Compagnie de Jésus, à saint Ignace de Loyola et à saint François-Xavier, son ami. Tous les deux furent canonisés en 1622, et déjà deux ans après, on leur dédia, dans l’église Saint-Michel, ces deux autels.
Saint François-Xavier est un des missionnaires les plus significatifs de l’histoire de l’Eglise. On l’envoya en Indes, d’où il continua son chemin jusqu'au Japon. Il mourut en 1552, sur l’île de Sancian, aux portes de la Chine, en ce temps-là hermétiquement close à l’extérieur. Saint François-Xavier connut et reconnut (l’un des premiers) la culture et la religiosité hautement développées des peuples de l’Extrême-Orient. Il a fortement contribué à susciter en Europe un vif intérêt pour les Indes, le Japon et la Chine.
